Studium změn sekundárních struktur DNA kmenových buněk diferencujících na tkáňových nosičích s různými mechanickými vlastnostmi

Nedávné studie potvrdily, že kultivace kmenových buněk na tkáňových nosičích s různými mechanickými vlastnostmi může vést ke změnám v jejich sekundárních strukturách DNA, jako je tvorba či zánik i-motivů a G-kvadraplexů, regulujících buněčnou genovou expresi. Navrhovaný projekt si klade za cíl prohloubit znalosti v oblasti diferenciace kmenových buněk na tkáňových nosičích s různými mechanickými vlastnostmi. Konkrétně bude studovat změny v sekundárních strukturách DNA během diferenciace kmenových buněk pomocí imunofluorescenčních technik a genových sekvenačních metod G4 ChIP-seq a RNA-seq. Projekt bude zkoumat vzory a vztahy mezi mechanickými vlastnostmi tkáňových nosičů a změnami struktur G-kvadraplexů a i-motivů během diferenciace kmenových buněk derivovaných z lidské tukové tkáně a jejich vazbu na regulační mechanismy kmenových buněk. Pochopení podmínek podporujících změny v sekundární struktuře buněk může být použito jako nástroj pro regulaci genové exprese mající široké spektrum terapeutických aplikací v současné době sahajícím až k cílenému doručování léčiv při léčbě rakoviny.